（1）扶正固本：
多囊肾肾囊肿早期无明显临床症状，或时有腰部不适，或家族中有多囊肾患者，早期偏肾阳虚者补肾壮阳，偏”肾阴虚”者滋阴补肾。
（2）理气活血：
由于水湿瘀积肾内，可阻碍气机，导致”气滞”血瘀，气血水互结为患，故肾囊肿的中医治疗时应注意理气活血。有”血尿”者清热止血；腰部瘀块明显者，活血化瘀止痛；腹痛”发热”者，清热解毒，活血化瘀。
（3）标本兼顾：
多囊肾发展至后期，肾用先司，浊毒内停而成关格重症，故有湿浊者应利湿化浊；有水气者，应利水行气。
自发性”感染”在”单纯性肾囊肿”中罕见，而一旦发生就难以同肾痈鉴别。有时囊肿内可出血，突然发生时，可引起剧痛，出血可来自囊肿壁上伴发的癌肿。
囊肿位于肾下极并紧贴输尿管时，可加重肾盂积水，而尿液对肾盂的压迫可引起背痛。这种梗阻还可以使肾脏发生感染。因此时病变严重时，甚至会发生癌变。
